Figlio di Giovanni Bonifacio e Luigia Busdon. Francesco, secondo di Bette fratelli, nasceva a Pirano i17 settembre 1912. Dedicatosi alla Chiesa. il 27 dicembre 1936 fu ordinato sacerdote. Nell'estate del 1939, dope due anni di apostolato a Cittanova, fu mandato ad assumere la cum di Villa Gardossi. La sera dell' 11 settembre 1946, mentre tornava a casa da Grisignana. passando per S. Vito e sotto Peroi. fu catturato da agenti dell' Ozna e scomparve per sempre; In matinee i fratelli infruttuosamente lo cercarono. vivo o morto. Nessuna notizia trapel6 mai sulla sua fine.
L' I I settembre alle 18 a Trieste nella chiesa di Sant'Antonio Taumaturgo il vescovo presiedera una concelebrazione eucaristica nel 50°ç anniversario della morte di Don Francesco Bonifacio.